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增值稅發票系統升級版是在現有增值稅發票系統基礎上的一次大規模升級，與舊系統相比主要有以下七大變化：（一）增值稅發票系統升級版是對增值稅防偽稅控系統、貨物運輸業增值稅專用發票稅控系統進行整合升級完善后的增值稅發票系統。（二）增值稅發票系統升級版實現增值稅一般納稅人使用一套稅控設備（金稅盤或稅控盤均可）加密開具增值稅專用發票、增值稅普通發票、貨物運輸業增值稅專用發票和機動車銷售統一發票；小規模納稅人使用使用一套稅控設備（金稅盤或稅控盤）加密開具增值稅普通發票和機動車銷售統一發票。（三）增值稅發票系統升級版實行聯網開票，開具的發票數據經過稅務數字證書系統的安全認證，通過互聯網實時上傳稅務機關，作為納稅申報、發票數據查驗及相關稅收征管事項的依據。通過實時上傳功能，納稅人每開具一張發票都可以即時將發票明細上傳到稅局端數據庫，減輕了每月集中抄報數據給稅局造成的壓力，同時也節省納稅人辦稅時間。（四）納稅人使用增值稅發票系統升級版時，需配套使用加載稅務數字證書的金稅盤或稅控盤，將數字證書內置在稅控裝置內，實現納稅人身份認證、發票數字簽名，加密上傳的安全功能。納稅人使用數字證書進行安全認證，辦理涉稅業務無需另行遞交紙質資料，實現無紙化辦稅。（五）升級版對所開具發票的票面信息進行全部采集。現有系統只采集發票票面數字七要素信息，升級版將實現采集發票全票面信息，并在系統采集過程中實現發票的逐票驗簽工作，保證發票數據安全入庫。（六）增值稅發票升級版通過電子底賬系統信息的實時自動傳輸和匯總清分，最終形成了納稅人申報抵扣所需的所有電子信息，全面推廣后將逐步取消掃描認證，大大減輕納稅人的負擔，提高納稅人納稅申報的質量，落實總局“兩個減負”的要求。（七）納稅人可在增值稅發票系統升級版中填開并上傳《開具紅字增值稅專用發票信息表》或《開具紅字貨物運輸業增值稅專用發票信息表》。主管稅務機關接收并經系統自動校驗后，生成帶有“紅字發票信息表編號”的《信息表》，并將信息同步至納稅人端系統中。銷售方憑稅務機關系統校驗通過的《信息表》開具紅字專用發票。紅字專用發票應與《信息表》一一對應。納稅人也可憑《信息表》電子信息或紙質資料到稅務機關對《信息表》內容進行系統校驗
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